Просроченные платежи считались в недоимке, и по ним взыскивались пени. Последние могли быть списаны по просьбе заемщика, а выплаты недоимки отсрочены (на 4 следующих полугодия), если просрочка была вызвана "особыми бедствиями", наличие которых удостоверялось уездной земской управой. В случае отсутствия льготы и неуплаты недоимки в течение следующего за просрочкой полугодия земля неисправного заемщика шла в продажу с публичных торгов.
Ссуды до 1906 г. выдавались наличными деньгами. Средства для их выдачи получались путем выпуска и продаж государственных свидетельств Крестьянского поземельного банка, приносивших 5,5% годового дохода и погашаемых посредством годовых тиражей на сумму погасительных взносов. Реализация и погашение свидетельств производились (до ноября 1905 г.) Государственным банком. Министру финансов при этом предоставлялось право разрешать их выпуск на сумму не свыше 5 млн. руб.
До 1895 г. Крестьянский банк выдал 14924 ссуды на сумму 82,4 млн. руб. под залог 2 41 1,7 тыс. дес. земли. В том числе, в пределах Европейской России (без Царства Польского) 11 693 ссуды на 58 689 тыс. руб. под залог 1 938 тыс. дес. Удельный вес Крестьянского банка в общем объеме операций учреждений ипотечного кредита составлял в 1895 г. (по Европейской России) 11,6% по числу ссуд, 3,8% по их сумме, 4,5% по площади заложенных земель. Банк к 1895 г. значительно уступал частным акционерным земельным банкам, лидировавшим в системе ипотечного кредита, и даже Дворянскому, образованному позже, но стремительно наращивавшему свои операции (12,5% по числу ссуд, 30,2% по их сумму, 24,0% по площади заложенных земель).
Главной сферой деятельности Крестьянского поземельного банка в 80-90е гг. XIX в. были южные степные (Таврическая, Екатеринославская, Донская), украинские (Киевская, Волынская, Подольская. Харьковская, Полтавская, Черниговская) и белорусские (Минская, Витебская, Могилевская) губернии. На них к 1895 г. приходилось почти 2/3 выданных Банком ссуд. Среди его клиентуры преобладали товарищества крестьян. Им за 1883-1895 гг. было выдано 8 546 ссуд (57,3%), на сумму 48,5 млн. руб. (58,8%) под залог 1 431,8 тыс. дес. (59,4%). За ними шли сельские общества и лишь потом отдельные домохозяева. Причем, доля единоличников и в сумме выданных ссуд, и в общей площади заложенной земли была ничтожна мала. Однако они являлись самыми крупными покупателями (в расчете на двор). По Отчетам Крестьянского банка в первые два периода его деятельности площадь купленной земли на один двор составляла у отдельных домохозяев 14 дес., в товариществах - 8,6 дес., в сельских обществах - 5,6 дес. Крестьяне-домохозяева были не только самыми крупными, но и самыми исправными плательщиками долгов по ссудам. Показателем платежеспособности разных групп клиентуры Банка являются данные о продаже с торгов земель, купленных крестьянами с помощью Банка.
Второй период ознаменовался расширением круга банковских операций. До 1895 г. деятельность Банка ограничивалась исключительно выдачей ссуд на покупку земли, приобретаемой крестьянами у землевладельцев. Теперь же по новому Уставу от 27 ноября 1895 т. он получил право действовать различными способами: выдавать ссуды на покупку земли, предоставлять ссуды под земли, уже купленные крестьянами, и, наконец, покупать земли за собственный счет для последующей перепродажи крестьянам.
Крестьянский банк использовал собственный капитал (предельный размер которого был определен но Высочайшему Манифесту от 14 ноября 1894 г. в 50 млн. руб.) на приобретение таких помещичьих имений, покупка которых непосредственно крестьянами была затруднена (в зависимости: 1) от состава имения как по величине, так и по сложности хозяйства в нем; 2) от состава покупателей, сложности распределения между ними земли до покупки и отсутствия средств на доплату; 3) от срочности и особых условий сделки при покупке с торгов и проч.). За 9 лет (1896-1905 гг.) Банку было предложено 2785 имений общей площадью 4981,1 тыс. дес. Из этого числа большая часть была либо им отклонена, либо расстроилась по другим причинам. Банк тщательно отбирал имения, руководствуясь их пригодностью для продажи крестьянам. Главными основаниями к отклонению покупки были: плохое качество угодий, бездоходность имений, непригодность их для крестьянского хозяйства, задолженность, значительно превышающая их стоимость, высокие цены и проч. Стоимость имений, приобретаемых Крестьянским поземельным банком, устанавливалась согласно учрежденным Министерством финансов 12 июня 1896 г. правилам оценки покупаемых имений. В основу оценки была положена действительная доходность имений, определяемая (в отношении земельных угодий) по долгосрочной аренде, по съемным ценам на один урожай и, наконец, по производительности почвы.
Всего за период 1896-1905 гг. Банком было куплено 477 имений (17,1% от числа предложенных) площадью 904,6 тыс. дес. за 62.9 млн. руб. Из приобретенной Банком земли крестьянами до 1906 г. было куплено 670,1 тыс. дес. (74%). Преобладали, как и при посреднических покупках, товарищества (78,4% по площади купленной земли), затем шли сельские общества (20,6%) и отдельные домохозяева (1,0%).
В литературе бытовало представление, что деятельность Крестьянского банка была чуть ли не главным фактором, обусловившим рост земельных цен в конце XIX - начале XX в., а покупка земель Крестьянским банком часто рассматривалась как "маневр" правительства для поддержания высоких цен на землю. Отсюда делался вывод, что больше всех "пострадали" крестьяне, которым "втридорога" пришлось платить за землю. В действительности же, цены на земли, купленные крестьянами у Банка, в подавляющем большинстве были ниже тех, что платили крестьяне частным владельцам, а часто и ниже средних земельных цен по всем видам сделок по Европейской России.
Покупка земли у Крестьянского банка позволяла увеличивать землевладение малоземельным крестьянам (она была для них более доступна, так как цены на земли из имений Банка были ниже, чем при посреднических покупках, в среднем за этот период - 76 руб. против 93 руб.). Среди покупателей банковский земли удельный вес безземельных был выше, чем среди крестьян - участников сделок при содействии Банка (14% против 11%).
В первые два периода деятельности Крестьянского банка покупки при его содействии еще не играли большой роли в общем процессе мобилизации земли: с 1883 по 1892 гг. их доля составляла 6,6%, а в 1893-1897 гг. - 6,2% от всей площади земли, поступившей на земельный рынок. В конце века этот показатель поднялся до 15,9%. При рассмотрении таких покупок по отношению к одному крестьянскому землевладению значение Банка становится более очевидным: в 1883-1892 гг. из всех крестьянских покупок на Банк приходилось 22,3%, а в 1893-1897 гг. - 23,8%. К концу XIX в. удельный вес Банка в общем объеме крестьянских покупок увеличился до 48,8%, т.е. почти половину земель крестьяне приобретали при содействии Банка или у него непосредственно. Значение банковской деятельности более всего проявилось в Черноземной полосе, куда с развитием операций Банка переместился центр всех крестьянских покупок. За 17 лет (1883-1899) покупки с помощью Банка составили здесь 52% общей "прибыли" крестьянского землевладения; в Нечерноземной полосе это соотношение равнялось 35%.
Роль Банка в увеличении частной земельной собственности у различных категорий заемщиков была неодинакова. Крестьянские общества и товарищества в конце XIX в. приобретали при содействии Банка (в той или иной форме) наибольшую часть своих земель (в 1899 г. общества - 86,9%, а товарищества - 73,3%). Что касается единоличных покупок крестьян, то до 1906 г. они, покупая землю лично, предпочитали пользоваться услугами акционерных земельных банков или становились заемщиками Дворянского банка, купив часть заложенного здесь имения. В акционерных земельных банках в конце XIX в. на крестьян приходилось 7,3% от общего числа всех заемщиков. Успешно развивали свою деятельность среди крестьян Московский, Виленский, С.-Петербургско-Тульский, Харьковский, Херсонский, Бессарабско-Таврический и другие акционерные земельные банки. В банковской практике была распространена распродажа состоящих в залоге банка имений по частям (парцелляция) с переводом на крестьян-покупщиков долга; не менее популярной была прикупка земли путем залога ранее приобретенной земельной собственности. Среди клиентов -не дворян Дворянского банка на крестьян в 1895 г. приходилось 4,5% общей площади земель, перешедших через Банк к новым владельцам, а в 1898 г. уже 9,2%. )