Чир. Весной в половодье поднимается по вискам и лайдам в озера для нагула, где встречаются особи чира в возрасте до 16 лет. Нерестится только в реке в начале октября в местах торошения осенней шуги, основные нерестилища по сообщению А.А.Козлова расположены в среднем течении Индигирки. Соотношение самцов и самок в нерестовом стаде 1:1. Нерестовой ход чира в нижнем течении начинается в августе, в это же время активизируется его промысел. В среднем течении чир появляется в сентябре. Запасы чира находятся в хорошем состоянии.

Сиг-пыжьян в бассейне Индигирки распространен повсеместно. Запасы сига находятся в хорошем состоянии.

Сибирский елец широко распространен как в самой реке так и в притоках. Наибольшие концентрации отмечаются в августе-ентябре. когда елец начинает скатываться из притоков в Индигирку, и весной (май-июнь) во время нереста. Нерестится главным образом в притоках. Первыми с боковых речек начинают скатываться более крупные ельцы, завершают миграцию неполовозрелые особи.

Река колыма. Озера и виски значительно повышают биологическую продуктивность реки. Из ту водных рыб здесь становятся обычными сиг, налим, щука, окунь, карась, и ерш, а из полупроходных нельма, омуль и ряпушка. Всего в бассейне Колымы обитает 30 видов рыб.

Сибирский осетр встречается от дельты реки до правого притока реки Шаманихи, впадающей в Колыму в 1069 километров от ее устья. Нерестилища осетра расположены в главном русле реки в месте впадения в Колыму реки Ожогина (877 километров от устья), и предположительно на участке реки от города Среднеколымска до поселка Зырянка. (Рубан 1999). Численность колымской популяции осетра всегда была никой, вылов редко превышал 1-3 тонн.

Нельма. Численность колымской популяции на столько низка, что восстановление ее без искусственного воспроизводства невозможно. Растет и нагуливается в дельте Колымы в опресненных участках моря, для размножения поднимается вверх по реке, заходит в реку Ясачную. Мальки нельмы питаются зоопланктоном, затем переходят на питание бентосными организмами и очень рано начинает хищничать, используя для питания молодь рыб.

Ледовитоморский омуль в летнее время расселяется вдоль берегов Восточно-Сибирского моря. Нагуливается на шельфе в зонах минимального влияния пресных вод, где расположены более продуктивные в гидрологическом отношении участки. Из вех сиговых омуль занимает наиболее северные районы, выдерживает соленость до 20, 22%. В зимнее время с уменьшением речного стока морская вода с соленостью до 30% в плотную подходит к побережью и омуль перемещается в дельту. Нерест происходит во 2-ой половине сентября и в октябре перед самым ледоставом на песчаном галечном грунте на глубине около 2 метров. Нерестилища расположены в среднем течении Колымы В русле и в левых притоках, Ясачной рассохе, Омулевке по которой производители омуля поднимаются вверх на 50-100 километров. Скат отнерестившихся особей продолжается до декабря. Колымская популяция омуля крайне малочислена. )