Муксун использует кормовые возможности прибрежной части шельфа Восточно-Сибирского моря с соленостью до 8%. Зимой муксун всех возрастных групп концентрируется в протоках дельты. Запасы муксуна находятся в чрезвычайно напряженном состоянии.

Сибирская ряпушка. В дельте и авандельте концентрируется в основном, зимой, весной же при первой подвижке льда часть ряпушки с половыми продуктами 3-5 стадии зрелости поднимаются по потокам дельты и заходят в пойменные озера, где выгуливаются. В начале августа нерестовое стадо заходит в Колыму и массовый ход начинается в низовьях, в районе Походска, 15-20 августа. Крупное нерестилище ряпушки расположено в районе участков Ермолово-Тимкино, где имеются для нереста подходящие грунты и глубины.

Чир. В водоемах озерно-речной системы Колымы численность его довольно высока. Весенний ход чира начинается сразу после вскрытия Колымы и поднятия уровня воды в реке в начале июня. По освободившимся вискам чир из реки заходит в ближайшие пойменные озера, а в годы с высоким паводком и в более отдаленные тундровые и лесотундровые озера, имеющие связь с рекой , где и происходит нагул практически всех возрастных групп. Состояние запасов чира в бассейне Колымы удовлетворительное.

Сиг-пыжьян в Колыме встречается повсеместно обычен и в озерах Колымо-Индигирской низменности. Колымский сиг значительно уступает по темпу роста только сигу из Вилюйского водохранилища. По характеру питания сиг можно отнести к рыбам с широким пищевым спектром. Сеголетки его питаются зоопланктоном, но уж к осенью (сентябрь-октябрь) начинают преобладать бентосные организмы. Основным нагульным периодом для колымского сига является лето. С конца лета в течении осени сиги начинают нерестовые миграции в притоки и на речные участки расположенные у порогов и перекатов. Нерест происходит в последних числах сентября в начале октября на песчаных и песчано-галечных грунтах. Запасы значительные.

Пелядь в бассейне Колымы обитает озерно-речная и озерно-карликовая форма. Растет озерно-речная пелядь довольно быстро и половой зрелости уже достигает в возрасте 3-х лет. После вскрытия Колымы в первой декаде июня пелядь как чир и сиг, для нагула заходит в озерно-височные системы, где в течение сезона нагуливается. Выход ее из озер обусловлен в основном скоростью падения уровня воды в реке, молодь не может находиться в этих озерах длительное время, редко выходя в реку. В маловодные годы темп роста пеляди резко снижается, пелядь становится тощей, снижается плодовитость. Особенно богаты пелядью левобережные озера нижнего течения Колымы. В крупных термокарстовых озерах обитает обычная и измельчавшая формы. В пойменных озерах живет только крупная пелядь. (Новиков и другие 1972 год). В наших условиях в среднем течении реки Колымы пелядь представлена двумя возрастными группами: 4 и 5 лет. Основу питания пеляди составляет зоопланктон; но включает и рыбу. Состояние запасов пеляди стабильно.

Щука распространена от верховьев до дельты, наиболее многочисленна в висках и озерах. В среднем течении занимает сходные с окунем биотопы и очень редко встречаются в основном русле реки. В нижнем течении Колымы по данным Новикова А.С. (1966год) основным объектом питания щуки являются сиговые, на долю которых приходится до 37% по частоте встречаемости, отсутствует елец. Несколько иначе обстоит дело с питанием у щуки, населяющей среднее течение, где основу ее питания составляют чукучан, елец и ерш.

Окунь довольно широко распространен в бассейне реки. В среднем течении встречается повсеместно, но немногочислен. Расселен чрезвычайно неравномерно, держится преимущественно в устьях маленьких рек и ручейков, небольших заливах, висках заходит в озера. Молодь окуня питается зоопланктоном, постепенно переходя на питание зообентосных организмов, взрослые включают в свой рацион рыбу, которая служит им основным кормом.

Сибирский елец в бассейне реки встречается повсеместно от верховьев до дельты, как в самой реке так и в висках и пойменных озерах. Весной, во время нерестовых миграций и осенью в период скатав реку, образует значительные промысловые скопления. Нерест колымского ельца происходит в июне, когда вода прогревается до 12 градусов по Цельсию, икра выметывается как на песчано-галечный субстрат, так и на растительность. Запасы удовлетворительны.

Чукучан заселяет участки реки с быстрым течением и каменистым дном, так и с медленным течением и илистым грунтом. Как правило не заходит в стоячую воду и и в озерах почти не встречается. Большую часть жизни проводит в русле. Распределение его в реке не постоянное, в период высоких паводков выходит на затопленные участки, причем первыми подходят мелкие особи и рассредоточиваются на мелководьях. Крупные же рыбы расселяются на глубине. В среднем течении встречаются повсеместно. В конце мая начале июня идет на нерест в притоки с быстрым течением и песчано-галечным грунтом, нерестует на глубине 2-3 метра.

Вилюйское водохранилище.

Зарегулирование речного стока и образование водохранилища внесли существенное изменение в фауну рыб, затопленного участка бассейна реки Вилюй и нижнего блефа. В нижнем блефе, например изменение экологической обстановки привело к полному уничтожению крупных нерестилищ нельмы, заходившей в реку Вилюй на нерест из реки Лены, что безусловно отразилось на численности и величине ее вылова в реке Лене. Весной 1972 году Вилюйским экспериментальным рыбоводным заводом в зоне Вилюйского переменного подбора были впервые выпущены личинки пеляди, с 1975 года началась интродукция ряпушки, с 1999 года байкальского омуля. Таким образом, формирование ихтиофауны в Вилюйском водохранилище произошло за счет вселяемых пеляди и рябу шки. В настоящее время ихтиофауна представлена 21 видом, принадлежащим к 10 семействам. Условия среды обитания рыб накладывают своеобразный отпечаток на их экологию, на состав, структуру и динамику численности популяций. Кормовая популяция позволяет вселить ценные породы рыб как осетр и нельма.

Озеро Ниджили.

Содержание кислорода в воде озера за долгие годы снизилось, и особенно заметно зимой, когда озеро сковывается ледяным панцирем. Озерно-речные рыбы более требовательны к кислородному режиму по сравнению с карасем и гольяном, частью погибли во время зимних заморов частью ушли из озера в Вилюй. В озере остались карась и гольян. Нерест карасейприурочен к участкам озера с сильно развитой растительностью и глубиной 1,5 метра. Чаще нерестовые участки расположены в прибрежной зоне с незначительными глубинами и хорошей водной растительностью. В озере Ниджили на местах нереста карасей насыщенность кислородом воды колеблется от 110 до 149%. За один нерест самка откладывает около 40 тысяч икринок, которые приклеиваются к стеблям растений. Икра, упавшая на дно, погибает. Личинки из икринок начинают выклевываться через неделю. В возрасте десяти суток начинают совершать незначительные плавательные движения а на13-е сутки становятся активными и питаются. Несмотря на довольно высокую плодовитость карася, площадь за сева икрой его нерестовых участков невелика. Установлено, что из всей отложенной икры в естественных условиях мертвые икринки составляют 67,7%, неоплодотворенные -17,6%, развивающиеся-14,7%. Значительный ущерб естественному воспроизводству карася в озерах наносят дрейфующие льды. Под действием ветров они выталкивают с литрами на берег часть икры карася вместе с растительностью. Пищей карася служат организмы планктона, бентоса, водная растительность, детрит. Форма тела карася и окраска зависят от условий обитания и кормности озера. Слабо упитанные особи имеют окраску от черного до светло-сероватого, хорошо упитанные, жирные караси золотисто-медного цвета. У карасей старших возрастных групп компоненты питания более разнообразны. Существенное значение в питании карася из озера Ниджили сохраняется за рачковым кормом (дафнии, циклопы). Темп роста и упитанность карася озера Ниджили характеризует удовлетворительное состояние его популяции. )